Dzień ten został ustanowiony w 1993 roku z inicjatywy młodzieżowego ruchu Papieskich Dzieł Misyjnych we Włoszech na pamiątkę męczeńskiej śmierci arcybiskupa San Salwadoru św. Oskara Arnulfo Romero.
„W Dniu Misjonarzy Męczenników obejmijmy modlitwą wszystkie osoby zakonne i świeckie posługujące na misjach, często w trudnych i niebezpiecznych warunkach, z narażeniem własnego życia. Dzięki ich odważnej posłudze wspólnoty misyjne mogą wzrastać i rozwijać się” – powiedział rzecznik Konferencji Episkopatu Polski, ks. Leszek Gęsiak SJ.
Również dzisiaj na całym świecie giną misjonarze. Według informacji zebranych przez Agencję Fides, w 2022 roku na całym świecie zostało zamordowanych 18 misjonarzy – kapłanów, osób zakonnych i świeckich.
Wśród współczesnych polskich misjonarzy, którzy ponieśli śmierć w czasie pełnienia posługi misyjnej, są o. Zbigniew Strzałkowski i o. Michał Tomaszek, franciszkanie, zamordowani 9 sierpnia 1991 roku i beatyfikowani 5 grudnia 2015 roku, a także 26-letnia Helena Agnieszka Kmieć, polska wolontariuszka, członkini wolontariatu misyjnego salwatorianów. Zginęła 24 stycznia 2017 roku w boliwijskiej Cochabambie.
