Inicjatorem i gospodarzem wydarzenia był Marszałek Województwa Kujawsko-Pomorskiego Piotr Całbecki, a głównym organizatorem Klub Inteligencji Katolickiej w Toruniu.

Honorowy Patronat nad obradami konferencji objęli: abp Tadeusz Wojda, metropolita gdański i przewodniczący Konferencji Episkopatu Polski; bp Wiesław Śmigiel, ordynariusz toruński oraz Muzeum Jana Pawła II i Prymasa Wyszyńskiego w Warszawie. Przewodniczącym komitetu naukowego konferencji był prof. ucz. dr hab. Michał Białkowski.

W słowie wstępnym prof. Białkowski przypomniał słowa ówczesnego prezydenta Torunia, Wojciecha Grochowskiego, który stwierdził, że wizyta Jana Pawła II była najszczęśliwszym dniem w historii miasta. Zaznaczył, że podczas spotkania z ludźmi nauki papież zostawił przesłanie nie tylko dla akademików, ale także dla każdego człowieka, który zdobywa wiedzę. 

Marszałek województwa Piotr Całbecki przypomniał, że 8 czerwca w Bydgoszczy po raz pierwszy zostanie wręczona nagroda kopernikańska. W tym roku otrzyma ją abp Grzegorz Ryś. Będzie ona wręczana co roku.

Bp Wiesław Śmigiel zauważył, że spotkania takie jak to są pomnikiem stawianym Janowi Pawłowi II. Zwrócił uwagę, że poznawanie nauczania papieża pomaga lepiej żyć. Przypomniał rowniez nauczanie z czercowego nabożeństwa sprawowanego przez Jana Pawła II 25 lat temu na toruńskim lotnku.

Wśród osób otwierajacych obrady był również prorektor elekt prof. ucz. dr hab. Radosław Sojak jako przedstawiciel władz UMK. Stwierdził on, że wobec nauczania Jana Pawła II częstokroć jesteśmy spóźnieni i "każdy wysiłek, by tę myśl dogonić, zasługuje na szczególne uznanie".

Pierwszą część obrad otworzył dk. prof. dr hab. Waldemar Rozynkowski. Przypomniał on historię nadania Janowi Pawłowi II honorowego obywatelstwa przez miasta i gminy województwa oraz doktoratu honoris causa przez toruński uniwersytet. W kolejnym wykładzie ks. prof. dr hab. Dariusz Kotecki przedstawił biblijne inspiracje w encyklikach, katechezach, ale i poezji Jana Pawła II.

W osobistych wspomnieniach prof. dr hab. Krzysztof Zanussi zwrócił uwagę na umiejętność uważnego słuchania drugiego człowieka, charakterystyczną dla Jana Pawła II, oraz jego ciekawość świata, rozwoju. Prof. dr hab. Krzysztof Stachewicz przedstawił syntezę rozwoju filozofii chrześcijańskiej. Zaznaczył, że "Jan Paweł II głosił kult prawdy i tego oczekiwał od kapłanów". Grzegorz Polak, zastępca dyrektora Muzeum Jana Pawła II i Prymasa Wyszyńskiego w Warszawie, przedstawił nauczanie Jana Pawła II dotyczące kultury. 

W drugiej części konferencji prof. Michał Białkowski wskazał, w jaki sposób Karol Wojtyła jako biskup krakowski dbał o rozwój nauki katolickiej, wydział teologiczny na KUL-u oraz prace Komisji do spraw Nauki Katolickiej. Jako ciekawostkę warto dodać, że choć ks. Wojtyła był literatem, poetą, filozofem, prowadził duszpasterstwo akademickie przy Politechnice Krakowskiej. 

Prof. dr hab. Paweł Skibiński z Uniwersytetu Warszawskiego przedstawił statystyki dotyczące spotkań Jana Pawła II ze środowiskiem naukowym w Polsce oraz scharakteryzował tematykę apeli skierowanych do ludzi nauki. Przypomniał również, że to środowisko papież otaczał szczególną modlitwą. Ks. dr Albert Warso z KUL-u skupił się na nauczaniu kard. Stefana Wyszyńskiego dotyczącym rozumu i wiary. 

Dr Stanisław Jaromi OFMConv. przedstawił postulaty encykliki papieża Franciszka "Laudato si'" oraz zadania Ruchu Ekologicznego św. Franciszka z Asyżu. Ks. prof. ucz. dr hab. Bogdan Giemza SDS zaprezentował papieskie wypowiedzi o sporcie jako działalności, która sprzyja integralnemu rozwojowi człowieka.

Na zakończenie prof. Białkowski przypomniał, że jako społeczeństwo znaleźliśmy się w momencie, gdy kontestuje się osobę i nauczanie Jana Pawła II. Tymczasem jego nauczanie jest zawsze aktualne i warto spytać siebie samych, co uczyniliśmy dla jego popularyzacji. Jest to pytanie skierowane szczególnie dla tzw. pokolenia JP2.

Wśród słuchaczy była m.in. prof. Cecylia Iwaniszewska, dyrektor Książnicy Kopernikańskiej Danetta Ryszkowska-Mirowska oraz młodzież z II Liceum Ogólnokształcącego w Toruniu.