Bp Philippe Jourdan urodził się 30 sierpnia 1960 r. w Dax (Francja). Ukończył matematykę i inżynierię w Krajowej Szkole Dróg i Mostów w Paryżu (1983). W tym czasie został numerariuszem Opus Dei Uzyskał doktorat z filozofii na Papieskim Uniwersytecie Świętego Krzyża w Rzymie (1987).

Został wyświęcony na kapłana inkardynowanego do Prałatury Świętego Krzyża i Opus Dei 20 sierpnia 1988 roku.

Był duszpasterzem akademickim w Paryżu i ojcem duchownym Prałatury Opus Dei we Francji. W 1996 r. został wikariuszem generalnym administratora apostolskiego Estonii, a trzy lata później także proboszczem parafii katedralnej w Tallinie. Od 2005 r. jest biskupem-administratorem apostolskim Estonii (jego nominację ogłoszono w przeddzień śmierci Jana Pawła II). administratorem apostolskim Administratury Apostolskiej Estonii.