W czwartek, 9 października 2025 roku mianowano pięciu Sędziów Trybunału, który zajmie się sprawą byłego jezuity – ks. Marka Rupnika. Skład sędziowski tworzą kobiety oraz duchowni, którzy nie należą do Dykasterii Nauki Wiary ani nie pełnią żadnych funkcji w Dykasteriach Kurii Rzymskiej. „Wszystko to ma na celu lepsze zagwarantowanie – jak w każdym procesie sądowym – autonomii i niezależności wspomnianego Trybunału” - czytamy w opublikowanym dokumencie.

Ks. Marek Rupnik – były jezuita ze Słowenii, znany twórca mozaik zdobiących sanktuaria w Watykanie, Lourdes, Fatimie i wielu innych miejscach na świecie. Od 2018 roku pojawiły się wobec niego poważne oskarżenia o wykorzystywanie seksualne oraz nadużycia duchowe i psychiczne, głównie wobec sióstr zakonnych. Łącznie zgłosiło się około 30 ofiar.

W 2020 roku Rupnik został już ekskomunikowany „latae sententiae”, czyli „wiążącej mocą samego prawa" za rozgrzeszenie współwinnej grzechu przeciw VI przykazaniu Dekalogu – nie cudzołóż. Ekskomunika została jednak cofnięta, co wywołało falę krytyki. W czerwcu 2023 roku został wydalony z zakonu jezuitów za „uporczywe nieposłuszeństwo”. Mimo to został inkardynowany do diecezji Koper w Słowenii.

W 2023 roku papież Franciszek uchylił przedawnienie, otwierając drogę do procesu sądowego. Na pytanie o termin rozpoczęcia rozprawy, kard. Víctor Manuel Fernández – prefekt Dykasterii Nauki Wiary tłumaczył, że wszystko musi odbyć się zgodnie z procedurami. „Istnieją techniczne terminy, jak choćby powiadomienie ofiar. Pracujemy z wymaganą dyskrecją” – wyjaśnił.

W związku informacjami o życiu ks. Rupnika, rozpoczęto usuwanie lub zasłanianie jego dzieł, którymi są głównie mozaiki. W marcu 2025 roku sanktuarium w Lourdes zasłoniło mozaiki jego autorstwa.

W czerwcu ubiegłego roku kard. Seán O’Malley, przewodniczący Papieskiej Komisji ds. Ochrony Nieletnich, zaapelował do Kurii Rzymskiej, by „unikać przesłania”, że Stolica Apostolska jest obojętna na cierpienie psychiczne tak wielu osób. „Roztropność duszpasterska powinna powstrzymać nas od prezentowania dzieł sztuki w sposób, który może sugerować obronę oskarżonych” – napisał przewodniczący Papieskiej Komisji.