Ks. Wątroba proboszczował w bazylice św. Elżbiety w latach 90. przez pięć lat i dwa miesiąca. Została wówczas odbudowana po pożarze i poświęcona osobiście przez papieża Jana Pawła II. Do Warszawy ks. Wątrobę powołał ówczesny biskup polowy Sławoj Leszek Głódź. Pełnił funkcję m.in. dziekana garnizonu Warszawa. Zbiegiem okoliczności trwało to tyle samo czasu, co jego proboszczowanie we Wrocławiu.
Ks. Wątroba nie odcina się jednak od warszawskiej centrali, bo nowy biskup polowy mianował go koordynatorem dziekanów wojskowych w Polsce.
- Będzie takim naddziekanem - wyjaśniał we Wrocławiu wiernym biskup polowy.
- Cieszę się z powrotu do Wrocławia, bo Wrocław to swojskość, rodzinna atmosfera, a Warszawa to tymczasowość - stwierdził ks. Wątroba.
Zapowiada dalsze prace remontowe w bazylice. Wierni już cieszą się, bo kościół w przyszłym roku dostanie ogrzewanie. Obecnie jest zimny, zawilgocony. A odbywają się w nim nie tylko Msze święte, ale i koncerty.
Bazylika św. Elżbiety to w hierarchi świątyń Wrocławia obecnie trzeci kościół - po katedrze i kolegiacie Świętego Krzyża. Dawniej miała rangę fary miejskiej, czyli głównego kościoła mieszczaństwa, stąd tak liczne w nim nagrobki i epitafia patrycjatu. Tytuł bazyliki mniejszej nosi od ubiegłego roku. Nadał go Ojciec Święty Jan Paweł II.