Nauczanie i wychowywanie młodego pokolenia było zawsze wpisane w posłannictwo i misję Kościoła. O doniosłości szkoły katolickiej w działalności Kościoła świadczy nauczanie Nauczycielskiego Urzędu Kościoła, w którym znaleźć można ważkie myśli o tożsamości, celach i zadaniach tej instytucji edukacyjnej.
Wychodząc naprzeciw potrzebom stworzenia tego rodzaju szkoły, 1 września 1999 r. zostało powołane dekretem arcybiskupa metropolity szczecińsko-kamieńskiego Zygmunta Kamińskiego Katolickie Gimnazjum im. św. Stanisława Kostki przy pl. św. Ottona w Szczecinie. Organem prowadzącym jest powstałe w 1996 r. Centrum Edukacyjne Archidiecezji Szczecińsko-Kamieńskiej, a nadzór pedagogiczny pozostał w gestii Zachodniopomorskiego Kuratora Oświaty.
Twórcy Katolickiego Gimnazjum ks. Andrzejowi Dymerowi zależało na tym, by instytucja miała charakter szkoły publicznej. W tych zabiegach wspomagała go ówczesna dyrektor Wydziału Oświaty w Szczecinie Maria Hajdul. Równoległym torem szły starania ks. Dymera o dobór odpowiedniej kadry pedagogicznej, utworzenie statutu i regulaminu szkoły oraz programu dydaktyczno-wychowawczego.
Obecnie do szkoły uczęszcza 245 gimnazjalistów. Mury „katolika” opuściło już 593 absolwentów. Szkoła zapewnia wszechstronny rozwój intelektualny i duchowy (stała obecność prefekta). Wystarczy wspomnieć, że podczas egzaminów gimnazjalnych średnio o 17% wyższe od średniej województwa noty osiągają uczniowie katolickiego gimnazjum i plasują się w czołówce szczecińskich gimnazjów. Chlubą szkoły są laureaci i finaliści konkursów przedmiotowych, recytatorskich, piosenki bożonarodzeniowej czy sukcesy sportowe. Gimnazjum Katolickie realizuje także wiele projektów, jak choćby „Nasi przodkowie - urok starych fotografii”, który włączony został do Międzynarodowej Sieci Pomysłów Edukacyjnych (uczestniczyły w nim dwie szkoły partnerskie z Austrii i Francji), czy eTwinning „My i inni, tożsamość kulturowa w Unii Europejskiej” we współpracy ze szkołą w Hiszpanii. W gimnazjum działa również Korpus Kadetów Maltańskich. Uczniowie mają możliwość zdobycia Europejskiego Certyfikatu Umiejętności Komputerowych ECDL.
Szkoła realizuje program wychowawczy i profilaktyczny, uwzględniając m.in. potrzeby wychowawcze uczniów, wychowanie patriotyczne i obywatelskie, promocję postawy szacunku dla innych i samego siebie, samorządność uczniowską, formy pomocy psychologiczno-pedagogicznej.
Do tradycji szkoły należy m.in. cotygodniowa Msza św., codzienna modlitwa, dni skupienia, wyjazdowe rekolekcje wielkopostne. Szkoła bierze udział w akcji wspomagającej edukację dzieci w Afryce. Uczniowie wspierają domy dziecka, odwiedzają Dom Samotnej Matki, Dom Kombatanta, Szpital Kliniczny.
Dziękując za jubileusz 10-lecia Katolickiego Gimnazjum, abp Andrzej Dzięga sprawował w jego intencjach Mszę św. W homilii wskazał na osobę patrona szkoły św. Stanisława Kostkę i apelował, by z niego czerpać wzór, jak z uporem walczyć, świadczyć o wierze, i kształtować swoje człowieczeństwo, stale wzrastać, od siebie wymagać i dawać świadectwo swojego życia. „Bóg jest obecny w nauce, jest sprawcą wszystkiego, co szlachetne… Szkoła katolicka pomaga w tym dojrzewaniu i odkrywaniu człowieka jako daru” - mówił, podkreślając, że nauka ma człowieka zbliżać do Boga.
Arcybiskup Dzięga poświęcił również sztandar szkoły, który prezentować będą: chorąży Adam Sawicki, przyboczne - Weronika Tyrka i Karolina Borkowska. Na sztandarze ze srebrnym wizerunkiem godła Polski (na czerwonym tle) i podobizną patrona św. Stanisława Kostki (na niebieskim tle) wyhaftowano słowa: „Bóg Honor Ojczyzna” oraz „Do wyższych rzeczy jestem stworzony”. Od tego momentu sztandar będzie towarzyszył we wszystkich ważnych chwilach szkoły. Po tej części uroczystości odbyło się ślubowanie pierwszoklasistów, którzy w ten sposób zostali przyjęci w poczet uczniów Katolickiego Gimnazjum. Następnie zaproszeni goście zwiedzili szkołę i obejrzeli montaż słowno-muzyczny przygotowany przez uczniów i wpisali się do księgi pamiątkowej.
Wizerunek szkoły jako wspólnoty jest jednym z elementów wzbogacających współczesną instytucję szkolnictwa. Wspólnota wychowująca powstaje w wyniku spotkania i współdziałania uczniów, rodziców, nauczycieli, dyrekcji i personelu. Wielkie znaczenie ma tutaj klimat wzajemnych stosunków i styl odnoszenia się do siebie. Nauczanie jest działalnością o nadzwyczajnym ciężarze moralnym, jednym z najwznioślejszych i najbardziej twórczych zajęć człowieka.
Niech w tym miejscu wolno mi będzie (przez trzy lata byłem prefektem w tym gimnazjum) na osobistą refleksję. Wspominam miło czas wzrastania z młodymi ludźmi, z którymi kontakt mam do dziś. Katechezy i ich niepowtarzalny klimat, gdzie ważniejszy był uczeń niż zeszyt, wspólne rozmowy na tematy wiary i nurtujące sprawy młodego człowieka; wspólne wyjazdy, inicjatywy, rekolekcje, integracje, przeżywane Msze św. Za to wszystko Bogu niech będą dzięki. W sposób szczególny dziękuję Agacie Sobczak - pierwszej wicedyrektor szkoły, która niezwykle mocno czuła katolickość szkoły, za jej perfekcję, zaufanie, obecność i świadectwo wiary, czasem za życzliwe zwrócenie uwagi, za sukces współtworzenia i kierowania zespołem nauczycieli.
Szkoła katolicka nie ma charakteru seminarium duchownego, ale jest szeroko dostępną szkołą (także dla wątpiących i niewierzących), w której katolicyzm jest obecny ze swoimi wartościami. Dziś w Polsce jest ponad 400 szkół katolickich. To wciąż za mało. Gdy jednak przeżywa się piękny jubileusz Katolickiego Gimnazjum w Szczecinie, widać szansę na rozsądny rozwój szkół katolickich dla dobra całego systemu edukacyjnego w Polsce.