- Z krwi tych męczenników zrodziła się nasza parafia św. Andrzeja Boboli - mówią warszawscy jezuici. Co jednak dokładnie zdarzyło się drugiego dnia Powstania Warszawskiego? Wiele osób świeckich ukryło się wtedy w kolegium jezuitów na Mokotowie. Niemcy po wtargnięciu do kolegium zapędzili zakonników i świeckich do kotłowni centralnego ogrzewania w piwnicy. Stamtąd skierowano uwięzionych do maleńkiego pokoiku, gdzie 4 osoby przypadały na 1 metr kwadratowy. Po pewnym czasie nastąpił pierwszy akt dramatu. Do pokoiku zaczęto wrzucać granaty, następnie strzelano seriami z karabinu maszynowego. Potem Niemcy oddalili się. Wracali jeszcze kilka razy i za każdym razem na nowo pastwili się nad uwięzionymi.
Opisuje to o. Felicjan Paluszkiewicz SJ: "Było południe. Z korytarza dochodził odgłos najpierw oddalających się, następnie powracających kroków. Nastąpił ciąg dalszy, tak samo makabryczny, rozpoczętej zbrodni. Wydawał się być kopią pierwszego: granaty, strzelanie. Krwawy zwał ciał ludzkich wypełniał całą przestrzeń. Niedobici opryskani krwią sąsiadów oraz mózgami, które wypłynęły z rozpłatanych czaszek, modlili się albo tylko jęczeli".
Podczas przerw w kaźni kilkunastu osobom udało się uciec i ukryć. Pozostałe osoby z pokoiku, zarówno martwe jak i jeszcze żywe, Niemcy oblali benzyną i podpalili, utrzymując ogień jeszcze przez 3 dni. Zdewastowali również dom zakonny.
Po wojnie szczątki męczenników zostały złożone w 4 trumnach. Potem zakopano je pod posadzką pokoju, w którym zostali zamordowani. Następnie pomieszczenie to zamieniono na kaplicę - kryptę. W portalu u wejścia do niej umieszczona jest tablica, na której wypisane są nazwiska osób zamordowanych. Tablica została poświęcona 1 sierpnia 1959 r. przez o. Bogusława Waczyńskiego SJ. Drzwi wejściowe do kaplicy obite są miedzianą blachą według projektu profesora Moszyńskiego. Wewnątrz znajduje się niewielki ołtarz z obrazem Chrystusa w Ogrójcu.
Żeby nawiedzić kryptę jezuickich męczenników należy wejść do kolegium głównym wejściem od strony ul. św. Andrzeja Boboli (róg Rakowieckiej) i zgłosić się na furtę. Furtian zaprowadzi do krypty i otworzy ją.