Ks. Paul Aulagnier urodził się 25 maja 1943 r. w Ambert w departamencie Puy-de-Dôme. W 1964 roku wstąpił do seminarium francuskiego w Rzymie, gdzie uzyskał licencjat kanoniczny z filozofii i ukończył pierwszy rok teologii na Papieskim Uniwersytecie Gregoriańskim. Podczas Soboru Watykańskiego II poznał arcybiskupa Marcela Lefebvre'a, za którym w 1969 r. udał się do Fryburga, gdzie ten ostatni utworzył swoje seminarium, które później przekształciło się w Seminarium Ecône. Ostatnie trzy lata teologii ukończył u dominikanów we Fryburgu. Święcenia kapłańskie przyjął z rąk arcybiskupa Lefebvre'a 17 października 1971 roku i został inkardynowany do diecezji Clermont. Został jednym z pierwszych członków Bractwa Kapłańskiego Świętego Piusa X (SSPX). Ks. Aulagnier był przez długi czas prawą ręką arcybiskupa Marcela Lefebvre. Był m.in. wicedyrektorem i wykładowcą w seminarium w Écône. W latach 1976-1994 kierował francuskim okręgiem braterstwa. Pod koniec lat 90. odszedł od Bractwa Piusa X.

Następnie współtworzył Instytut Dobrego Pasterza, erygowany kanonicznie w 2006 roku przez Benedykta XVI - wspólnotę życia apostolskiego, mającą za swój szczególny charyzmat duszpasterstwo w „nadzwyczajnej formie rytu rzymskiego” (w języku łacińskim, w liturgii „przedsoborowej”). Podlega on kompetencjom Kongregacji Nauki Wiary. Ks. Aulagnier założył seminarium tego Instytutu w Courtalain w diecezji Chartres. W czerwcu 2019 roku, w Périgueux kupił opuszczony klasztor św. Pawła z Thiviers, aby stworzyć dom rekolekcyjny.

Założone przez niego stowarzyszenie życia apostolskiego i stowarzyszenie kapłańskie jest obecne w wielu krajach z około 50 kapłanami i licznymi seminarzystami. Do Instytutu należy również wspólnota sióstr.